随着伍六七回到玄武国寻找他的身世，亦引起了七大暗影刺客的追捕。然而每一位暗影刺客都带着不同的目的和不同的过去，青凤的阴谋也在此浮出了水面。而此时等待着小鸡岛上的人民，又将是另一个危机，伍六七将如何面对他的抉择？

这是一部少年英雄成长史，以虚拟的“九州”世界为背景，讲述吕归尘、姬野、羽然等不谙世事的少年历经磨砺与坎坷，执着奋斗，携手互助，成长成熟，并发展出几段撼天动地的友情和爱情故事。北陆青阳部世子吕归尘作为质子来到东陆结识了一直不受父亲喜爱的庶子姬野，以及跟着爷爷避难而来的羽族公主羽然。三个小伙伴在太子学院中因身份原因饱受针对和挑战，在相互帮助和拯救的过程了建立起深厚的友谊，而羽然的开朗活泼洒脱个性也得到两个男孩的暗中倾慕，青涩的爱情正在萌芽。离国霸主赢无翳携天子以令诸侯，吕归尘、姬野、羽然追随一代忠将息衍等人发出正义之师，决战殇阳关，不料殇阳关之战的背后另有大阴谋。危难之际，少年们奋死而战，成长为一代领袖。

七剑合壁之后，马三娘命丧莎丽剑下，她的尸体顺着河流漂下，在一个雷雨之夜,马三娘从前偷来的雪舍利和雷电的力量相结合竟然让她复活了。万念俱灰的马三娘想起了十二年前被她抛弃的儿子，于是来到雪岛寻子。岁月悠悠，马三娘的儿子阿木已经长成了一位风度翩翩的英俊少年。阿木本性善良，可他身上却有一股邪恶的力量，一旦他动了怒气，额头上的第三只眼就会睁开，并发出强大的能量。马三娘得知阿木的第三只眼是天底下最邪恶的力量，于是企图诱使阿木用第三只眼夺取风、雨、雷、电四大神兽的内丹，进而得到麒麟,好让马三娘东山再起,称霸武林。灾难开始步步紧逼，麒麟危在旦夕。虹猫、蓝兔双剑出鞘，雷霆出击。刀光剑影里，正义与邪恶开始激烈交锋…

平凡少年韩立出生贫困，为了让家人过上更好的生活，自愿前去七玄门参加入门考核，最终被墨大夫收入门下。                                                                      　　墨大夫一开始对韩立悉心培养、传授医术，让韩立对他非常感激，但随着一同入门的弟子张铁失踪，韩立才发现了墨大夫的真面目。                                                                      　　墨大夫试图夺舍韩立，最终却被韩立反杀。通过墨大夫的遗书韩立得知了一个全新世界：修仙界的存在。                                                                      　　在帮助七玄门抵御外敌之后，韩立离开了七玄门，前去墨大夫的家中寻找暖阳宝玉解毒，并帮助墨家人打败了敌人。                                                                      　　通过墨大夫之女墨彩环的口中得知太南小会地址，韩立为追寻修仙人的足迹决定前往太南小会，拜别家人后……

网络动画《秦时明月之沧海横流》是由沈乐平执导、杭州玄机科技信息技术有限公司出品的中国3D武侠动画《秦时明月》系列（故事背景取自秦始皇统一六国到咸阳城被攻陷这段英雄辈出的历史时期，是一部以武侠为主题的全民型动漫）的第六部作品。