200X年，会动的玩偶突然从宇宙来到日本。不知道为什么，他们攻击的目标都是日本各处有名的景点。防卫队为了保护日本而进行战斗，却受到为什么要向这么可爱的玩偶攻击的舆论责难，进退两难。这时候，有人提出要对抗如此可爱的东西，不用可爱的东西是不行的！就这样一个由三位小学生组成的特别防卫队成立了！

这是一个魔女和人类共存的世界，当局所罗门组织了一支名为STN的行动部队，用以监视和猎捕会对人类造成威胁和伤害的魔女。罗宾（渡边明乃 配音）就是行动队中的一员，她本身亦是法力高强的魔女。当局将罗宾从欧洲派到了日本，参加猎捕魔女的计划。                                                                      　　随着时间的推移，罗宾渐渐开始对自己正在完成的事业产生了怀疑，她的搭档亚门（竹若拓磨 配音）对自己的态度一直不冷不热，与此同时，罗宾意外得知，亚门残酷的猎捕了他的前一任搭档，这令罗宾感到自危。与此同时，罗宾意外获得了及其强大的魔力，这让她的战斗力陡升，使其成为了所罗门重点防患的对象。

故事发生在位于大阪的安倍商店街中，无论什么时候，这里都洋溢着热热闹闹的欢快气氛。个性大大咧咧的少女朝比奈由美（松冈由贵 配音）从出生起就生活在这条商店街上，和她一起长大的，还有活泼好动，满脑子都是奇思妙想的今宫圣智，两人可谓是青梅竹马的玩伴，商店街的每一条街道，都被他们牢牢的敏记在心间。                                                                      　　谁知道某一日，拆迁队的到来彻底破坏了商店街祥和的气氛，甚至引发了可怕的诅咒，这诅咒令商店街的居民们穿越到了一个又一个奇妙的世界之中，开启了他们充满了刺激的不可思议的冒险。

樋口健太郎（泽城美雪 配音）的双亲在幼年时因车祸而去世，性格内向沉默寡言的他在学校里并不活跃，唯一的好友便是外表帅气成绩优秀的绫小路天（斋贺弥月 配音）。某日，一个叫做美纱（田村由里香 配音）的女孩出现并改变了健太郎的生活，她住在健太郎的隔壁，性格活泼又开朗，而她的真实身份，居然是实习天使。                                                                      　　美纱的开朗渐渐的感染了健太郎，而此时，外表可爱的实习恶魔紫亚（野上由加奈 配音）也来到了人间。个性迷糊的她失去了自己的记忆，寻找这段记忆，即是她此行最大的目的。健太郎和他的天使朋友们度过了一段有笑有泪的美好生活，然而，令他想不到的是，转眼间，注定的分别就已经来到了眼前。

塔奇克馬的日常 (英語：Ghost in the Shell: Tachikoma Days，日語：タチコマな日々, Tachikoma na Hibi;也被稱之為Tachikoma Specials) 是一部隨DVD附送的特典性質動畫短片，其出現在以DVD版本發行的電視動畫版攻殼機動隊的每話最後部分，就風格而言是部輕鬆搞笑的作品，作品的主角就是公安九課所使用的思考戰車塔奇克馬(Tachikoma),其內容上除了對部分劇情的哲學思考外也有起到對TV版動畫補完的作用.如今已經播放的攻殼機動隊 Stand Alone Complex以及第二部攻殼機動隊 S.A.C. 2nd GIG的每集的最後均有該短篇的身影，每集長度約為1分鐘左右.