堪称动画史上的最强对决到来！传奇大盗鲁邦三世（栗田贯一 配音）和他的战友次元大介（小林清志 配音）、石川五卫门（浪川大辅 配音）来到东京，以怪盗基德之名挑战日本警察和柯南（高山南 配音）。在此之后，鲁邦高调寄出预告书，扬言要盗取某银行内的稀世珍宝樱桃蓝宝石，为此国际刑警组织（ICPO）的鲁邦三世专门搜查官钱形幸一警部（山寺宏一 配音）与目暮警官（茶风林 配音）为代表的日本警视厅通力配合，决心给大盗迎头痛击。另一方面，意大利偶像歌手艾米里翁·瓦力迪（入野自由 配音）赴日卡演唱会，但威胁杀害偶像的恐吓信也随之而来。                                                                      　　人声鼎沸的演唱会会场，史无前例的对决拉开序幕……

或許過去，又或許未來，人類大規模向宇宙殖民。當人口膨脹到五千億的時候，散落在宇宙各個角落的人類返回故土地球，卻引發了傷亡慘重的歸鄉戰爭。爲了保護地球這片聖地，人類制定了蓋亞制裁，約定不許任何人染指這裏。可是曾經作爲聯合艦隊艦長的哈洛克（小栗旬 配音）卻背叛蓋亞制裁，駕駛着他的阿爾卡迪亞號高舉叛旗，成爲逃逸一百年之久的通緝犯。聯合艦隊長官伊索拉（森川智之 配音）指使自己的弟弟亞馬（三浦春馬 配音）混入阿爾卡迪亞號，探尋尼伯龍根人發明的永動機的祕密。在此期間，哈洛克率領船員向地球挺近，而聯合艦隊則在太陽系佈下天羅地網阻擋他的步伐。遙遠的故土，失落已久的真相，令所有人爲之震驚……                                                                      　　本片根據松本零士的經典科幻漫畫改編。

童年时期的一个盛夏，女孩子面码（茅野爱衣 配音）死于意外。这件突如其来的死亡事件，深深刺痛了她的五个儿时玩伴——仁太、安鸣、雪集、鹤见子以及波波。六人组成的秘密基地“超和平Busters”就此解散，活着的五人带着无法弥补的创伤各自疏远各自长大。十年后，面码居然以一种只有仁太能看见的形式，带着一个想要实现的愿望回来了。                                                                      　　本剧场版从面码已经在五个伙伴的帮助下“成佛”讲起，在面码完成心愿消失一年后，仁太他们五人重聚，各自给面码写信，回忆去年夏天发生在“超和平Busters”六人身上的奇迹。

熙攘喧嚣的大都会东京，游魂漫无目的地行走在城市的每一个角落。身穿校服的女高中生树里（土屋太凤 饰）曾经将自己深锁屋中，拒不登校，后来则选择从公寓楼顶一跃而下，结束了自己十几年匆匆的人生。此去经年，她早已忘记当初自杀的理由，甚至有时忽略了已经死去的事实。细细回想生前事，曾有交到的倾心好友，也曾有运动出色的青梅竹马，而如今俱成过眼云烟。曾经讨厌嘈杂低端的她，现在反而喜欢身处其中。树里仿佛是城市中唯一一个亡灵，没有任何说话对象，除了那些怂恿失落的人自杀的虫男。                                                                      　　这是她的孤独地狱，没有止境的旅程……