故事发生在伊良部综合医院精神科，作为那里的主治医生，伊良部一郎（三矢雄二 配音）每天都要面对形形色色的怪异患者。杂技演员山下公平（森川智之 配音）作为空中飞人的表演者成功次数为零。猪野诚司（高桥广树 配音）身为黑道的首领，却患有害怕一切尖锐物品的尖端恐惧症。棒球投手坂东 真一（浪川大辅 配音）即将要因为心理障碍而被驱逐出心爱的棒球队。畅销小说家星山纯一（三木真一郎 配音）正被怀疑自己的桥段已被使用过而饱受苦恼。                                                                      　　这些看似怪异的疾病其实指向的正是患者的内心，在超级美女助手真由美（山本由美 配音）的帮助下，一郎将撇除偏见，指导他们如何直面内心的恐惧从而达到自我痊愈的目的。

根据超人气动画『凉宫春日的忧郁』的原作小说派生出的四格恶搞漫画《小凉宫春日的忧郁》，于08年8月宣布了将改编为网络动画的消息。                                                                      　　本作漫画由《凉宫》的原作家谷川流担任脚本，于2007年开始连载，08年5月刚刚发售了漫画单行本的第1卷。                                                                      　　单行本发售之时，由于动画版『凉宫』在宣布第2季的制作后过了一年也迟迟不见动静，而小说原作的第10卷《凉宫春日的惊愕》也延期了1年多，所以FANS无处发泄的热情全集中到了漫画《小凉宫》之上，单行本一经发售迅速被抢购一空，就连多次紧急增印后也供不应求。                                                                      　　此次的动画版『小凉宫春日的忧郁』，将在动画共享网站YouTube中的角川动画频道内播出。同时，以『凉宫』中的“鹤屋”为主角进行二次创作的漫画作品《Nyoron☆小鹤屋学姐》（Nyoron为鹤屋学姐的口癖），也将被改编为网络动画并在同一频道播出。

今年，升上高中的大八木朔（前野智昭 配音）即将回到童年时代曾经居住过的小镇完成自己的高中学业。在那里，他遇见了给自己制造过童年阴影的青梅竹马明野美星（伊藤加奈惠 配音）。在美星的强迫下，木朔加入了美星所在的社团——濒临废社的天文社。                                                                      　　在天文社里，木朔结识了一帮热爱天文的朋友们。对木朔有好感，追随其而来的莳田姫（户松遥 配音），成熟稳重的学姐矢来小夜（早见沙织 配音），莫名其妙入社的江户川正志（高木礼子 配音），对天文有着超越一切的狂热爱好的路万健康（间岛淳司 配音）。这些性格有些怪异的社友们在不断的给木朔制造麻烦的同时也丰富了木朔的课余生活，在不知不觉中，木朔对曾经一无所知的天文学渐渐产生了兴趣。