200年前，超元世界的人类和来自其他世界的怪兽发生了战争。为了对抗强大的怪兽，人类发明了超元卡装置，将怪兽封印在超元卡中，结束了战争。 主人公云天曾是一位热爱超元卡比赛的少年，但是体质特殊的他无法控制好超元卡中的怪兽能量。 一天，他意外从爸爸发掘的古遗迹中获得了一个神奇的卡盒。 云天决定前往寻找4张传说超元卡，希望用向超元卡许愿的方式找回哥哥。就这样，云天告别了父母，踏上旅程。
第12季讲述了白月初被涂山雅雅带到危险的“圈外”发动了她的独门绝技镜花缘，唤醒了白月初失落的记忆，揭开了东方月初当年是如何在道盟推动人和妖和平的背后故事。
故事描述在称为布雷斯提尔的世界，名为“吉尔多”的巨大组织独霸了航空技术，企图利用手中强大的科技力量控制世界。这个世界的两大国家安纳托雷和度西斯处于交战状态，为了争夺霸权，两国都委托吉尔多设计空中战舰，并且由吉尔多统一提供引擎。两名拥有一艘Oneship的飞行员克劳斯·沃克和拉维·海特，他们经营空运业务。两人在一次飞行器事故中救了名叫做艾尔维斯·汉密尔顿的少女，并且将她送往空中战舰西耶瓦那，从而卷入到悠关世界存亡的大战中去......
公元2019年（正化31年），为了取缔扰乱公共秩序和风俗，侵犯人权的行为，而制定的“媒体良化法”已经经历了30年的考验，媒体良化委员会与“图书队”之间的战争席卷了整个日本。 渴望成为防卫员的图书队员笠原郁，没有向双亲吐露自己的心声，每天勤奋地进行着军事训练。郁在高中时，曾经差一点被一名媒体良化队员抢去书本，好在一位图书队员将其解救。为了成为正义的伙伴，郁把那位连脸都没有记住的图书队员当作是王子，并决定自己也要加入图书队，担负起守护书的责任。 不久，有着卓越运动能力和满腔热情的郁，被派遣到 “图书馆・特种部队”里……
3022年，蔚蓝星被外星文明入侵，无数的战争机器通过传送站点来到了这里，战争机器疯狂缩小搜索范围，夏执序正在抵抗某种侵蚀......宇宙联邦派遣的队伍——阿尔法-300，同时出现在他的眼前。 “你能想象的魔法或者高等文明科技，其实是存在的。” 陈星瑶说出了这句话，她自称来自宇宙联邦纠察队——用可视化科技面板进行任务沟通，物品收纳，技能使用。 在接二连三的险情中，夏执序发现很多疑点，决定加入阿尔法-300，去变的更强，去探查那个真相。
