很久以前，无人居住的山里建立有人类最新的研究中心 某日，研究用的main computer突然拥有自己的意识而暴走，人类费尽千辛万苦阻止了暴走，取回了和平……看起来是这样的 回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，而准备了巨大萝卜，并选出战士们进行训练，某日，这一天终于来临了 站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go Buster！！ 他们的战斗，现在开始！
故事描述在称为布雷斯提尔的世界，名为“吉尔多”的巨大组织独霸了航空技术，企图利用手中强大的科技力量控制世界。这个世界的两大国家安纳托雷和度西斯处于交战状态，为了争夺霸权，两国都委托吉尔多设计空中战舰，并且由吉尔多统一提供引擎。两名拥有一艘Oneship的飞行员克劳斯·沃克和拉维·海特，他们经营空运业务。两人在一次飞行器事故中救了名叫做艾尔维斯·汉密尔顿的少女，并且将她送往空中战舰西耶瓦那，从而卷入到悠关世界存亡的大战中去......
这里是地球的某个角落，由丛林组成的原始岛屿。 奇怪的是，这里生活着三个像遭到抢劫一样的朋友。有人类少年“奥格利”， 笨熊“巴洛乌”，过度早熟的“蠢货”。 某一天，不知道是不是快递派送失误，从天上掉下了几个箱子，箱子里的各种东西给生活在原始世界的三位朋友带来了很大的混乱。 接触到陌生的现代文明的他们，今天究竟会度过怎样奇怪的一天，让我们拭目以待。
