很久以前，无人居住的山里建立有人类最新的研究中心 某日，研究用的main computer突然拥有自己的意识而暴走，人类费尽千辛万苦阻止了暴走，取回了和平……看起来是这样的 回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，而准备了巨大萝卜，并选出战士们进行训练，某日，这一天终于来临了 站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go Buster！！ 他们的战斗，现在开始！
故事讲述两派来到地球后，因为发生了一些“事件”，导致双方外形大变（也解释了两系列风格不同的原因）。也由于这些“事件”，变形金刚要隐藏于人类社会之中。如何去平衡一切关系是擎天柱作为领袖将要面临的考验，本作品的标题也由此而来。 值得一提的是，本次两派领袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久违的梦幻组合：来自初代动画的 Peter Cullen 和 Frank meijubar.net Welker！他们在阔别电视版的变形金刚作品多年后，再次一起回来共演这双经典的死对头！
地脉方兴，天荒欲破。天荒世界，人族只是无比弱小的族种，面临严峻的生存危险，又是其他种族的血食。人族四大守护年事已高，还没能找到合适的接班人，最后四人决定，将自身的血肉融入天荒大地，凭天地意志选择新的接班人。 数年之后，姬水村的第一天才——姬小发为神秘女子禹雪所骗，失去了自身的命轮，从而沦落为废人，彻底自暴自弃。 这一天，护神山的人来到了姬水村，他们接走了资质出众的孩童，以作为下一任的护神山接班人。姬小发命轮破碎，无法一同前往，便只好前往狐爷家，进行修炼。另外一边，荒蛮野兽正在肆意入侵人族部落，一个接着一个的强大反派正慢慢得袭入人族部落，姬小发所面临的彼岸，又将会是什么？
