讲述了一群善良正义的火车侠克服重重困难，最终拯救了世界的故事。
超星特工们为了阻止星盗首领雷帝斯抢夺大卡手上的超星萌宠哆哆，回到了十年前的空星域展开对决，雷帝斯将超星特工甩掉之后就消失了。既然无法抓住雷帝斯，唯有从大卡入手，而要接触大卡就必须重新考取驾照参加比赛。于是，超星特工开始了一边赛车一边执行任务的终结篇章。超星特工们团结一致，迎难而上，战胜一个个奇奇怪怪的赛车对手，捣毁雷帝斯布下的各种阴谋诡计，最后成功捣毁星盗集团，完成拯救超星宠萌的任务。
备长炭（野中蓝 配音）是一个身材娇小的蓝发少女，身着传统和服的她独自一人居住在林中的老屋之中。虽然独自生活有时会觉得孤独，但个性单纯开朗又勤劳的备长炭还是决定好好的珍惜每一天的时光。 好在孤独的日子不算太久，很快，备长炭的身边就聚集了一群同样可爱的朋友们，她还让出生在深宅大院的栎炭（野川樱 配音）明白了自己的命运应该由自己来掌控的道理。除此之外，胆小但聪明的竹炭（门胁舞 配音），其妹竹林（福圆美里 配音），天然呆桉树炭（中原麻衣 配音），无论哪方面看来都十分普通的芦荟（斋藤桃子 配音）还有傲娇可爱的莲炭（佐藤利奈 配音），她们都将备长炭看做自己不可缺少的朋友。在深林小屋中，备长炭快乐一天又开始了。
很久以前，无人居住的山里建立有人类最新的研究中心 某日，研究用的main computer突然拥有自己的意识而暴走，人类费尽千辛万苦阻止了暴走，取回了和平……看起来是这样的 回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，而准备了巨大萝卜，并选出战士们进行训练，某日，这一天终于来临了 站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go Buster！！ 他们的战斗，现在开始！
