西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。 仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。 然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。 这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了。
董卓火燒洛陽後，關東聯軍與西涼軍於虎牢關狹路相逢。關羽、張飛協助大哥三英戰呂布，劉備終於一戰成名。呂布暗中、要挾殘兵協助自己暗殺董卓。殘兵前往長安途中遭遇袁紹軍，幸得劉關張相助，劉備誤認撩原火爲子龍。長安城內，殘兵和呂布聯手，對抗以李儒爲首的西涼衆將。雙方鬥智鬥勇，李儒最終和董卓一同殞命。
故事讲述两派来到地球后，因为发生了一些“事件”，导致双方外形大变（也解释了两系列风格不同的原因）。也由于这些“事件”，变形金刚要隐藏于人类社会之中。如何去平衡一切关系是擎天柱作为领袖将要面临的考验，本作品的标题也由此而来。 值得一提的是，本次两派领袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久违的梦幻组合：来自初代动画的 Peter Cullen 和 Frank meijubar.net Welker！他们在阔别电视版的变形金刚作品多年后，再次一起回来共演这双经典的死对头！
11000年前，宇宙高等文明德诺文明爆发内战，烈阳星主神太阳之光毁灭了德诺星系。诺星上将杜卡奥携带德诺星系的神河超级战士基因来到银河系地球。 公元2017年，烈阳星太阳之光蕾娜来到处于核前时代的银河系地球文明，同时隐藏于地球上的神河基因得到了激活，率先觉醒基因的是划破虚空的银河之力和弑神之力诺星战神。与此同时，监视地球神河基因许久的三个集团，天使集团、恶魔集团、超神学院各自行动。华夏超神学院率先迅速行动将分散于地球的神河超级战士聚在超神学院，取名代号——雄兵连，由太阳之光蕾娜担任队长指导战士们进行先进的尖端对抗战术学习。 恶魔女王莫甘娜化名凉冰来到地球暗中传播堕落自由主义，谋划着如何消灭神圣凯莎。 天使集团派出左翼护卫彦为首的代表前往地球，而天使彦告知，冥河文明饕餮先头部队已直逼地球。 同时，天使集团、恶魔集团的行动渐渐浮出了水面……
