三方國界

　　明末，官府腐败，民不聊生。一次，红姑所在的郭家杂技大班遭霍太爷门下追杀，幸得好心的霍公子相救。红姑、郭师傅又被劫入红姑寨，见到上一代郭家班人寨主老红姑。老红姑讲述了当年霍太爷怎样残害他们。红姑下山报仇。面对善良的霍公子，红姑转身离去。这时，红姑寨被官兵洗劫，老红姑牺牲。押运粮草的霍公子把粮草献给新寨主红姑。官府下令将其斩首。红姑率军劫法场，就下霍公子。最后，霍公子跟随红姑一起投奔闯王李自成去了。

刚刚结束了与叛忍集团“晓”的抗争，木叶村被一股诡异不祥的气氛所笼罩。此时此刻，漩涡鸣人（竹内顺子 配音）沉浸在对家人的思念中，孤独无助。某个晚上，心情糟糕的鸣人巧遇刚刚和家人吵架的小樱（中村千绘 配音），二人在公园闲聊之际，神秘的斑（内田直哉 配音）突然出现，并向二人使出瞳术。眩晕过后，鸣人和小樱发现看似一如平常的木叶村，曾经熟悉的伙伴竟然性格发生巨变。一连串不正常的事件令二人苦恼不已。更令人难以置信的是，包括佐助以及鸣人的父母波风水门（森川智之 配音）和玖辛奈（篠原惠美 配音）也出现在他们的面前。斑的阴谋慢慢展开……                                                                      　　本片根据岸本齐史的漫画原作改编，为该作品第九部动画剧场版。