本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
即《偷星九月天之童年故事》之后的又一部《偷星九月天》动画作品。中二少年（少女）们的无节操校园日常、脑洞大开的各种诡异课程、VV侦探学院魔鬼老师与BT校长，各种暗恋与秀恩爱的美好至极的学生生活（三月四月你们够了喂！）尽在《偷星九月天Q》第二季。
奈基虽然还只是一个十岁的少年,但是他已经是英国国立魔法学校的优秀毕业生了.以成为出色的魔法使为目标的奈基,为了完成毕业论文而来到麻帆良学园担任女子中等部二年A班的导师.刚来报道的第一天,温和的奈基就不幸的惹到了班上活泼脱线的女生神乐坂明日菜,虽然他小心翼翼的保守自己会使用魔法的秘密,但是一次为了救班上的图书管理员宮崎のどか同学,不小心被神乐坂明日菜看到,并且因为意外KISS而与之结下契约,成为魔法使从者.奈基和神乐坂明日菜等31位女生的笑闹校园生活从此揭开了序幕……
在那不久的未来，东京湾内突然坠落了一艘宇宙飞船，发现飞船中乘坐着150名外星人。.....1年之后，日本政府为那些无法返回故乡星球的宇宙人们颁发市民权。并以“亲爱的朋友们”为名，将他们称呼为“DearS”。 DearS们为了学习日本的语言和日本的风俗，采取了“借宿”制度（住在他人家里）。就这样DearS们伴随着他们的美貌一起渐渐被世人所接受.... 就在这个时候，因一起事故的关系，DearS本部运算的一位少女从货物卡车上掉了出来，随后又被一个普通高中生 幾原武哉 给发现...之后被带回了 武哉 了家， 武哉 给 这位少女启名为“莲” 惊人的是 莲 1个晚上就学会了日文，最出乎意料的是她一见到 武哉 就叫他“主人”.....就这样两个人开始了异星间交际，而 莲 平时都笨笨的关系，随着周围的人越来越多，总是引起一次又一次的骚乱，并给 武哉 添麻烦........
住人公是一个名叫饭冢和人的中学生，除了酷爱动画片他与别的少年没有丝毫不同。某个雨天，和人的注意力给一只被遗弃的可爱"小狗"吸引了，幸好得到一个言行举止怪异的少女七濑成惠(父亲是到地球侦查的外星人，母亲侧是地球人的星际混血儿七濑成惠，由于出身特殊，成长过程的14年的中一直过着没有朋友的生活，)及时出手相救才幸免被外星怪物所伤，于是开始了他们的交往生活。后来饭冢和人才意外发现成惠是个在地球上长大的外星人。她拥有瞬间移动的特殊能力。第一次的约会，和人在丸尾的指导和跟踪下开始行动。虽然事情的进展和丸尾所说的有极大的差别，但在和人的努力下最后还是赢得了成惠开朗的笑容。随着感情的上升，成惠要求到和人的家里，这使得他大为惊喜。可惜不幸被成惠看到他的成人刊物，在匆忙扯开话题后二人开始看动画片，感觉到很开心的成惠对和人送了一份特别的礼物。以七濑成惠与饭冢和人两人为主轴的恋爱故事，就此展开了…
