即《偷星九月天之童年故事》之后的又一部《偷星九月天》动画作品。中二少年（少女）们的无节操校园日常、脑洞大开的各种诡异课程、VV侦探学院魔鬼老师与BT校长，各种暗恋与秀恩爱的美好至极的学生生活（三月四月你们够了喂！）尽在《偷星九月天Q》第二季。
公元2019年（正化31年），为了取缔扰乱公共秩序和风俗，侵犯人权的行为，而制定的“媒体良化法”已经经历了30年的考验，媒体良化委员会与“图书队”之间的战争席卷了整个日本。 渴望成为防卫员的图书队员笠原郁，没有向双亲吐露自己的心声，每天勤奋地进行着军事训练。郁在高中时，曾经差一点被一名媒体良化队员抢去书本，好在一位图书队员将其解救。为了成为正义的伙伴，郁把那位连脸都没有记住的图书队员当作是王子，并决定自己也要加入图书队，担负起守护书的责任。 不久，有着卓越运动能力和满腔热情的郁，被派遣到 “图书馆・特种部队”里……
超星特工们为了阻止星盗首领雷帝斯抢夺大卡手上的超星萌宠哆哆，回到了十年前的空星域展开对决，雷帝斯将超星特工甩掉之后就消失了。既然无法抓住雷帝斯，唯有从大卡入手，而要接触大卡就必须重新考取驾照参加比赛。于是，超星特工开始了一边赛车一边执行任务的终结篇章。超星特工们团结一致，迎难而上，战胜一个个奇奇怪怪的赛车对手，捣毁雷帝斯布下的各种阴谋诡计，最后成功捣毁星盗集团，完成拯救超星宠萌的任务。
